Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLP1Q92989 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms