Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG8Q8ND04 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms