Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CA13Q8N1Q1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CA13Q8N1Q1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CA13Q8N1Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CA13Q8N1Q1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CA13Q8N1Q1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CA13Q8N1Q1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CA13Q8N1Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA13Q8N1Q1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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