Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms