Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms