Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms