Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms