Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9C2Q5TAH2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms