Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SZT2Q5T011 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms