Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms