Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESCO2Q56NI9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESCO2Q56NI9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms