Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms