Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms