Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms