Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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