Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM1Q14671 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 515.76■□□□□ 0.119e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.069e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.039e-7■■□□□ 12.5
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PUM1Q14671 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 214.64□□□□□ -0.079e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.169e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.229e-7■■□□□ 12.5
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PUM1Q14671 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)6.31□□□□□ -1.42e-8■■□□□ 12.5
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PUM1Q14671 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 EIF2B4-207ENST00000462749 1089 ntTSL 318.33■□□□□ 0.524e-7■■□□□ 12.5
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PUM1Q14671 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-7■■□□□ 12.5
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PUM1Q14671 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 221.89■■□□□ 1.093e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 221.2■□□□□ 0.983e-9■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 AGO2-202ENST00000517293 422 ntTSL 38.34□□□□□ -1.072e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.26□□□□□ -1.572e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 RCN2-204ENST00000557805 691 ntTSL 322.13■■□□□ 1.132e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 517.73■□□□□ 0.432e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 212.02□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-206ENST00000504275 479 ntTSL 311.62□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NUDT21-205ENST00000567110 607 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-208ENST00000507921 1516 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-204ENST00000502481 473 ntTSL 410.18□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 BRD7-204ENST00000475877 671 ntTSL 39.91□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CDYL-206ENST00000469671 732 ntTSL 39.54□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-214ENST00000515845 505 ntTSL 38.61□□□□□ -1.032e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 MTDH-202ENST00000519293 629 ntTSL 37.31□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 MTDH-204ENST00000521933 565 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 MTDH-205ENST00000522104 486 ntTSL 26.17□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NUDT21-204ENST00000566340 581 ntTSL 35.71□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 12.4
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