Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPARCL1Q14515 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms