Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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