Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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