Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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