Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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