Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACSM1Q08AH1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACSM1Q08AH1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.3 ms