Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms