Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKL1Q00532 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms