Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms