Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms