Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTA1P68133 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms