Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS29P62273 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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