Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND3P61587 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND3P61587 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND3P61587 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND3P61587 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RND3P61587 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms