Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME5P56597 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME5P56597 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME5P56597 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME5P56597 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME5P56597 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME5P56597 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms