Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MVDP53602 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MVDP53602 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MVDP53602 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MVDP53602 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MVDP53602 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MVDP53602 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MVDP53602 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MVDP53602 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MVDP53602 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MVDP53602 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MVDP53602 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MVDP53602 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MVDP53602 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MVDP53602 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms