Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSBP53539 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FOSBP53539 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOSBP53539 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSBP53539 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSBP53539 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSBP53539 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms