Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms