Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms