Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms