Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPB2P35606 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB2P35606 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB2P35606 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms