Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms