Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA1P25391 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms