Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAV1P15498 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAV1P15498 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAV1P15498 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAV1P15498 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAV1P15498 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAV1P15498 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms