Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MS4A1P11836 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms