Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms