Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GADD45BO75293 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45BO75293 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms