Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD28O15084 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms