Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIBO00712 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIBO00712 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIBO00712 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIBO00712 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIBO00712 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIBO00712 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIBO00712 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIBO00712 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIBO00712 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms