Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHODO00212 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHODO00212 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHODO00212 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHODO00212 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHODO00212 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms