Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms