Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms