Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms