Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms