Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX24Q9Y343 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms